1、表面的皮膚不同：淡墨魚表面皮膚光滑，沒什麼雜質，而海水墨魚表面有白色鹽晶。
2、生存環境不同：淡水墨魚生活在淡水環境中，海水墨魚生活在鹹水環境中。
3、營養價值不同：相比較來説海水墨魚的營養價值比淡水墨魚的營養價值高。
4、淡幹墨魚在晾曬過程沒有加鹽醃製的墨魚乾，而海水墨魚就是在晾曬過程中加鹽醃製的墨魚乾。
5、淡幹墨魚沒有加入食鹽，這種墨魚乾手感比較輕，表面比較光滑，吃起來帶有墨魚的純正鮮香原味。海水墨魚在晾曬過程中要添加大量食鹽進行醃漬，最後得到的墨魚乾含有較多鹽分。手感較重，而且表面會有明顯的鹽漬，這種墨魚乾的鹹度較大，食用之前必須反覆浸泡漂洗，將過重的鹹味稀釋後才能食用。
6、從保質期的長短上來説，淡幹墨魚的保質期比較短，而海水墨魚的保質期相對來説較長些。但無論是淡幹墨魚或海水墨魚，晾曬結束後都必須密封起來冷凍保存，否則都容易變質。
