御花園有三方奇石為木變石、諸葛拜北斗和海蔘石。
1、“木變石”，另有硅化木、木化石、樹化玉等稱謂，屬於化石類觀賞石。是黑龍江將軍福僧阿供奉給乾隆的貢品，該石樹紋明顯，脈絡清晰，傲然獨立，風骨依舊。乾隆皇帝對此木變石十分的喜愛，還曾親自題詩一首，以示珍藏。
2、諸葛拜北斗石，上大下錐橢圓形。硅質化程度較高，卵石。灰白底色和輕褐色組成圖案。從圖紋上看，雖歷經百年，仍清晰可辨，畫面感強，也是御花園唯一一方水衝畫面石，而且是道家風格的石頭。一長袍道士，雙手抱拳，面北向天揖拜。正前方的雪點斑痕，似北斗七星，正合道家之説。
3、海蔘石，系珊瑚排泄物化石，屬於中型觀賞石，為御苑傳承石中僅見。造型獨特，其形恰如一條條首尾相連的“海蔘”，因而被命名為“海蔘石”。該石晶體完整，呈半透明狀，動態感強，石上佈滿毛絨絨的刺狀，憨態可掬，惹人駐足。
