公文整理歸檔是指機關、團體、企業、事業單位的文書處理部門在文件輸入完畢後，按有關規定，對其中有查考保存價值的文件，按照他們在形成過程中的自然規律和特點，進行分類、排列、編目，使之有序化，並向檔案室或檔案人員移交的過程。
1、辦結暫存：將收發文中已經辦理完畢的公文，即收文經注辦、發文經分發遞送出去的公文，在公文處理部門暫時存放一段時間，以待次年上半年分別立卷歸檔或清退、銷燬。
2、整理立卷：文件立卷是整理與保管公文的一種方法。即將已經辦理完畢並有保存價值的公文，在收集齊全的基礎上，按一定的標準(形成機構、內容性質等)分類，而後按其一定的特徵與聯繫組合成案卷。一般在次年上半年進行此項工作。
3、移交歸檔：歸檔是把按規定組合好並編目的案卷交給檔案部門，也叫存檔。公文歸檔，應當根據其相互聯繫、特徵和保存價值分類整理立卷，要保證檔案的齊全、完整，能正確反映本機關的主要工作情況，以便於保管和利用。
