睾丸縮小變軟是睾丸萎縮典型表現。一側或者雙側都有可能發生此病。睾丸萎縮的大部分患者可產生不男性不育症。睾丸萎縮時常發生在腮腺炎或者是睾丸外傷之後。先天性睾丸萎縮並不常見，且難以被治癒。男性如果腎氣匱乏容易導致睾丸萎縮。除先天性睾丸萎縮之外的其他睾丸萎縮病只要耐心調治就可以去的康復。
病毒感染可導致睾丸萎縮，且病毒感染是誘發兒童與青少年睾丸萎縮最為常見的病因，尤其是流行性腮腺炎病毒，俗稱“痄腮”病。當睾丸受此病毒侵襲後，睾丸內的生精組織會受到破壞，睾丸體積縮小，質地變軟。
損傷可導致睾丸萎縮，陰囊或睾丸部位發生過撞擊性損傷，造成陰囊血腫或睾丸裂傷等，即使創傷癒合，睾丸也會長期處於供血不充裕狀態，發生萎縮。
炎症可誘發睾丸萎縮，重度睾丸炎，發病時睾丸腫脹、疼痛，可以持續多日。由於細菌侵犯而造成睾丸組織破壞，導致睾丸組織發生萎縮。
放射性物質影響可以使得睾丸萎縮，凡是較長時間接觸放射性物質者，例如長期從事X線、同位素等職業人員，如未作很好保護，會引起睾丸萎縮症。
內分泌疾病是睾丸萎縮的重要原因，睾丸是一種內分泌器官，主要產生雄激素，而身體上許多指揮內分泌的器官，如腦垂體、腎上腺、丘腦下部等出現疾病，都會干擾睾丸的功能，引起睾丸萎縮。
除此之外藥物影響也能夠使得睾丸萎縮。患者如果經常服用含有毒性劇烈的藥物就可以導致。比如服用含有砷的藥物製劑就可以使得雄性激素受到對抗，進而導致睾丸萎縮。乙芪酚成分也可導致睾丸萎縮。所以病人用藥時一定要謹慎選用含有這些成分的藥物。
