在內戰爆發時，蔣介石名義上擁有軍隊430多萬，而對面的中共軍隊只有130多萬。但是蔣介石的部隊內部存在着嚴重的派系問題，在解放戰爭，這些軍隊經常出現見死不救的問題。這些問題並不是什麼小事，它直接影響了三大戰役的結果和國民黨集團固守西南計劃的失敗。本來蔣介石佔盡了優勢，但是由於內部的問題太多，最終國民黨集團輸掉了在大陸所有的家底，只能選擇退往台灣。
一、國民黨軍隊的派系問題從建軍初期就一直存在
再中國軍閥混戰時期，孫中山依靠南方軍閥勢力與北方的北洋政府對抗。在組建軍隊時，吸收了很多南方各個軍隊的士兵，這就是國軍派系鬥爭的起源。蔣介石揮師北伐時，他一共有8個軍的兵力，這些軍隊的組成部分十分複雜。在戰爭中一步步擴大之後，也就漸漸形成了利益集團。在中原大戰之後，蔣介石確立了自己在全國的地位。在這次戰爭中，蔣介石收編了大量的西北軍部隊，這就又增加了派系的組成部分。在抗日戰爭中，各派軍隊雖然也都一致抗日，但是自己內部並不和睦，見死不救的情況屢屢出現。在抗戰勝利之後，蔣介石對各派軍隊都進行改編。出來蔣介石的中央軍之外，還有李宗仁的桂軍、閻錫山的晉軍、傅作義的察綏軍等等。
在經過核算以後，蔣介石中央軍的兵力佔總兵力的53%。雖然蔣介石的軍隊佔多少，但是蔣介石的部隊也並非鐵板一塊。即便是嫡系之中也是這個情況，陳誠的土木系和胡宗南的黃埔系相互內鬥，王耀武等人也有自己的勢力海歸派也是一股不可小視的力量。在中原大戰中，蔣介石吞併了西北軍，在西安事變之後又吞併了東北軍。再加上滇軍和川軍的加入，這就導致了蔣介石中央軍的軍隊內部也是派系林立。如果再算上那些被收編的偽軍和土匪，軍隊的組成就更是複雜。在和平年代，看不出什麼問題。但是在戰爭時期，嚴重的派系鬥爭有時比敵軍的傷害還大。例如閻錫山的舉動就非常讓人無奈，蔣介石在北方的軍隊起初不佔優勢，但閻錫山在抗戰結束以後，一直拒絕中央軍進入山西。
三、三大戰役中，見死不救的情況比比皆是
國共兩軍在東北較量的初期，解放軍並不佔優勢，林彪只能率領軍隊堅守黑龍江地區。但是此時國民黨方面出現了問題，陳誠接任東北地區的軍政事務之後，他更換了大量的非土木系將領，這直接導致了軍事進攻的癱瘓。國民黨軍隊暫時放棄了進攻機會，而林彪率領的東北野戰軍在休整之後開始了大規模的反擊。衞立煌出任東北剿總司令時，東北野戰軍在兵力和經濟上都超過了他。鑑於當時的局面，衞立煌也只能選擇固守。問題是林彪不會給他固守的機會，遼瀋戰役中共消滅國民黨軍隊47萬多人。蔣介石那固守錦州，可進可退的戰略規劃沒有實現。東北的問題暴露出國民黨軍隊派系鬥爭的一系列問題。
張靈甫率領了74師被包圍在孟良崮時，距離他最近的李天霞部選擇了見死不救。而另一支桂軍部隊距離他也很近，但這支軍隊同樣是出工不出力。最後張靈甫只能向外圍的兩支嫡系部隊呼救，這兩支部隊同於一個陣營，是願意幫忙的，但是它們的距離太遠。在東北地區的軍隊全軍覆沒之後，蔣介石希望把傅作義的50萬大軍調往中原地區。這樣一來，自己在兩淮一線的軍隊就達到了100多萬。但是傅作義沒有那麼傻，一旦傅作義離開了自己的根據地華北，那他就等於喪失了一切。雖然蔣介石一再命令傅作義南下，但是傅作義一直猶豫不決。在林彪率領百萬東北野戰軍南下之後，傅作義就是想撤退也來不及了。
三、川軍的倒戈致使蔣介石固守西南計劃的全面失敗
渡江戰役之後，蔣介石計劃把自己最後的家底退往西南地區。10餘年，他退往西南地區與日軍長期抗衡。現在蔣介石希望再次上演這個歷史，但是這次歷史無法重演，他因為他失去了美國的援助，所面對的對手也不同。在成都戰役時，胡宗南把自己最後的家底一共20多萬軍隊部署在成都城外，希望與解放軍進行最後的決戰。但是川軍卻發生了倒戈，最後導致防禦體系的全面崩潰。胡宗南曾經拍着胸脯説自己可以堅守西南三年以上，可是僅僅堅持了不到半年。解放軍進入成都之前，蔣介石連夜從成都飛回台灣。飛機幾乎是從解放軍的頭頂飛過的，但是解放軍並不知道這是蔣介石的飛機。固守西南計劃破產以後，蔣介石開始專心經營台灣，不過他首先要徹底解決軍隊內部的派系問題。
