生物熱消毒法是將糞便放入池中密封堆積發酵，既能殺死糞便中的病原微生物和寄生蟲卵，又不喪失肥效，是最常用的消毒方法，此法應注意要遠離飼養場所、河流、水井等100m以上。
1、物理消毒法是指用物理方法殺滅病原。包括機械清除， 如清掃、洗刷、通風、過濾等；高熱消毒，包括乾熱消毒和濕熱消毒，如火焰、蒸煮、高壓蒸汽消毒等；日光和紫外線照射消毒等。
2、化學消毒法是指用化學藥物（消毒藥品）殺滅病原的方 法。所用的化學藥物根據作用和殺滅能力分為滅菌劑和殺菌劑， 習慣上統稱為消毒劑。由於消毒劑和被消毒對象種類繁多，其化 學消毒方法也很多。
3、生物消毒法是指用生物熱殺滅、清除病原的方法。例如， 利用糞便、土壤中嗜熱菌繁殖產熱殺死病原微生物、寄生蟲幼蟲和 蟲卵等，但此法對細菌中的芽孢菌無效。
