銀杏毒性成分為銀杏毒及白果中性毒(白果酸，白果醇及白果酚等)。銀杏毒有溶血作用，服用量過大，易中毒，生品毒性更大，而以綠色胚芽最毒。白果的毒性成分能溶於水，加熱可被破壞，故本品熟用毒性小。若作為食品，應去種皮，胚芽，浸泡半天以上，煮熟透後才可食用。
一般中毒症狀為噁心嘔吐，腹痛腹瀉、發熱、煩躁不安、驚厥、精神委頓、呼吸困難、紫紺、昏迷、瞳孔對光反射遲鈍或消失;嚴重者可因呼吸中樞麻痺而死亡。
解救方法：
服後2-3小時內，應洗胃、瀉、利尿，服雞蛋清或活性炭，以減輕毒素的繼續吸收;
呼吸困難及紫紺者，給氧，並予呼吸興奮劑;驚厥抽搐者，給予安定、苯巴比妥等鎮靜，抗驚厥藥，靜脈注射高滲葡萄糖，及其他對症處理，中藥可用甘草30克，水煎服，或白果殼30-60克，水煎服，或用木香適量用開水磨汁，入麝香少許服之。
