20世紀50年代初，敗逃台灣的蔣介石、蔣經國父子痛定思痛，決定下大力氣改造國民黨組織。在此期間，曾發生過一起鮮為人知的“撤銷孔祥熙宋子文黨籍事件”，宋美齡在其中起到關鍵作用。
13名未歸隊黨員擬開除
蔣介石原計劃這次改造運動歷時兩年，到1952年10月國民黨第七次“全國”代表大會召開為止。國民黨第七次“全國”代表大會開過不久，台灣基隆、台中、新竹、台北等地的一些老黨員連續上書，反映黨的改造運動之後，仍有一些重要黨員還未歸隊，應對這些目無黨紀、對黨不忠誠者進行懲處。蔣介石指令國民黨中央常委、中央黨部祕書長張其昀負責餘下的整頓工作。
到1953年7月，張其昀向蔣介石提交專題報告，稱通過“發動黨員歸隊”“厲行黨員整肅”活動，仍有一部分黨員高級幹部，如在美國的孔祥熙、宋子文、李宗仁、孫科，在香港的顧孟餘、黃宇人、張國燾等人，既未重新登記，也未對今後的去向表示任何意見，上上下下對他們很有看法。因他們過去地位較高，身份顯赫，對他們採取何種措施，請蔣介石予以指示。
蔣介石指示：“我意，立即對在國外未歸隊的‘第六屆中央委員’發一通知，要求他們在三個月內歸隊，如逾期不歸，不論何人，一律撤銷黨籍。三個月後，你把未歸者的名單報來，我再核准。”根據蔣介石的指示，張其昀立即在“中央黨部”作了部署。國民黨“中央黨部”的通知發出去後，大多數未“歸隊要人”未表示任何意見。1953年10月底，蔣介石的親信唐縱向台灣“總統府”報送了一個海外未歸隊的“第六屆中央委員”名單，共十三人，宋美齡的姐夫孔祥熙、哥哥宋子文列頭兩名。名單後附建議，建議撤銷上述十三人的國民黨黨籍。
蔣介石過目後批示：提交“中央常委會”討論決定。
蔣介石扛不住宋美齡吵鬧施壓
經蔣介石祕書周宏濤送給蔣介石的這份簽呈，不巧被蔣夫人宋美齡看到了。得知了“黨籍總檢查”的原委，宋美齡大發牢騷：“這樣做很不妥！抹殺孔祥熙、宋子文過去對黨國立下的功勛，恰恰中了共產黨的挑撥離間計。……過去，他們為‘國家’作了很大貢獻無人肯定不説，反而受了很大的委屈;現在，他們不便回來，我們應該同情、理解他們的難處才對，才合情合理。要知道，他們不是對黨不忠誠，不是不願歸隊，而是無法歸隊。在這種情況下，‘中央’如果無緣無故地撤銷他們的國民黨黨籍，不但不智，對孔、宋二人來説，太不公平！”宋美齡隨後多次找蔣介石吵鬧，事件隨後發生了變化。
第二天上午，張其昀和唐縱請示，要將撤銷“中央委員”黨籍案發出去。蔣介石思慮半天后，面露難色地對他們説：“這個問題有些複雜，黨內有不同的看法，容我再考慮考慮。”
過了一會兒，他又對張、唐説：“‘立法委員’及其他身份的‘中央委員’為何不處理？為何只處理海外不歸的‘中央委員’呢？如果此文發下去，海外的那些‘中央委員’心裏不服。”
張其昀和唐縱從蔣介石的話裏聽出，此事可能有變。非常瞭解蔣介石心態的張其昀當即提出：為妥善處理此問題，暫緩發出撤銷十三名海外“第六屆中央委員”黨籍案。蔣介石同意了。
國民黨高層敢怒不敢言
隨後，中央黨部內部討論此事，張其昀等人才從周宏濤口中知道問題出在宋美齡身上，只好決定暫緩發出撤銷黨籍通知。
第三日，蔣介石為此事專門召見周宏濤，詢問道：“經國是否也是中央檢查小組成員？”原來，宋美齡懷疑把孔宋兩人列入除名名單，可能和蔣經國有關。周宏濤回答説沒有。蔣介石當即指示他：“你把這個情況告訴夫人，並把海外中委撤銷黨籍已經緩辦的處理，一併告知。”當天下午，蔣介石再次召見周宏濤，稱：“孔宋兩人功過尚未定論。海外黨員中另有類似者，類同辦理。不可以受中共宣傳影響，可以對他們發給黨證。”
就這樣，孔祥熙、宋子文等十三名居住在台灣島外的原國民黨“中央委員”，直到死時仍無一人被國民黨撤銷黨籍。
當時，國民黨高層及“中央黨部”知道此事內情的部分黨工對宋美齡此舉甚有意見，但又無可奈何。2003年9月30日，蔣介石的祕書周宏濤在台灣出版了一本回憶錄《我與蔣公——見證中華民國的關鍵變局》，他在書中用甚多筆墨談了此事的前後經過，感慨萬千地説：“孔祥熙、宋子文的許多行為，不論用當時或現在的標準來看，都是不應該的，經國先生就強烈地反對，蔣夫人被指包庇，因而受到社會的抨擊，但那是她的至親，是她精神上的倚賴;她自己無後，就把孔令侃、孔令儀、孔令傑、孔令偉視如己出。她年紀大了，也由孔令偉、孔令儀在紐約照料她。”
從周宏濤的這段話可看出，他當年對宋美齡極力阻撓蔣介石、蔣經國父子撤銷孔祥熙、宋子文的國民黨黨籍一事，是很有看法的。
